Les moisissures sont des organismes eucaryotes hétérotrophes. Les moisissures comprennent les levures unicellulaires et les moisissures filamenteuses multicellulaires. De nombreuses espèces fongiques sont capables de survivre dans des environnements oligotrophes (des zones où les éléments nutritifs des plantes sont relativement faibles et où il y en a beaucoup d’oxygène dans les régions plus profondes).